目前我國設施蔬菜生產中普遍存在著化肥施用嚴重超量、秸稈使用鮮受重視、肥料運籌比較隨意、專用肥料極其缺乏、施肥方法尤為不當等現象，不僅導致肥料利用率和生產效益低下，還導致土壤pH值降低、次生鹽漬化比例較大、有機質含量普遍處于中低水平、硝態氮和速效磷富集、重金屬積累、地下水硝酸鹽超標等一系列較為嚴重的問題——中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所，農業部植物營養與肥料重點實驗室 。
化肥施用嚴重超量
調查表明，全國主要設施蔬菜每畝平均化肥養分（N+P2O5+K2O）用量90.3kg，是全國農作物平均化肥養分用量的4.2倍。 主要設施蔬菜每畝平均肥料（化肥+有機肥）養分總用量158.0kg，其中N、P2O5和K2O施用總量分別為56.7kg、48.4kg和52.9kg，平均分別超出各自推薦施用量的1.2、5.3 和0.9 倍。按合理施肥條件下有機肥/有機物料替代化肥40%-50%的比例估算，設施蔬菜化肥養分減施潛力在40%以上。
秸稈使用鮮受重視
調查顯示，主要設施菜區有機肥用量不合理，每畝平均有機肥養分用量65.9kg，超出適宜用量20kg左右；區域間有機肥用量不均衡現象突出。 我國設施菜田施用的有機肥一般以雞糞、豬糞為主，含纖維素較少，對土壤腐殖質形成貢獻有限，而化肥的重要替代技術之一作物秸稈使用很少。
肥料運籌比較隨意
不注重設施蔬菜生長規律，對蔬菜各個時期的需肥種類及需肥量不了解，隨意施肥。由于設施蔬菜具有養分吸收范圍小、吸收強度大、吸收能力弱等特點，要求土壤養分供應強度大。設施蔬菜養分吸收是前期少，中后期快速增加，而土壤養分供應是前期過多，中后期明顯不足。常常造成土壤養分供應和設施蔬菜養分吸收明顯不同步，這與前期基肥化肥施用過多、中后期化肥運籌不合理等密切相關。 調查指出，全國設施蔬菜基肥化肥養分用量占化肥（基肥+ 追肥）養分總量比例過高，平均達到42.5%。
專用肥料極其缺乏
蔬菜要求鉀多磷少，一般N∶P2O5∶K2O吸收比例為1∶0.3-0.5∶1.0-1.5。 據調查，設施蔬菜施用的化肥品種大多不符合蔬菜生產要求，比較適合蔬菜養分需求的專用肥、水溶性肥料等專用新型化肥品種數量不到專門針對蔬菜研發的肥料品種總數的20%，而高磷化肥品種如磷酸二銨、三元復合肥、沖施肥等占較大比例，導致設施蔬菜磷施用比例遠超需求比例。
施用方法尤為不當
我國設施蔬菜生產中大水大肥現象很普遍，菜農習慣“肥大水勤，不用問人”，“大水大肥，肥隨水走”的管理模式，灌溉水和肥料的投入量遠遠超過了蔬菜實際需求量。比如多年沿襲的傳統做法是蔬菜定植后澆一次大水，一周后再澆一次緩苗水，而實際上小苗只需少量小水即可滿足要求。 設施蔬菜肥料過量和不合理施用不僅導致肥料利用率和生產效益低下，還導致土壤質量退化、地下水硝酸鹽超標、氧化亞氮排放和氨揮發引起的大氣污染等一系列較為嚴重的問題。 土壤質量退化主要表現在以下幾方面：
1、土壤pH值降低，現今設施管理措施導致土壤向酸化趨勢發展；
2、土壤次生鹽漬化比例較大，設施菜田土壤鹽分含量高出露地菜田近1倍；
3、土壤有機質含量普遍處于中低水平，僅12.1%的設施菜田達到肥沃菜田土壤有機質含量40-50g·kg-1的標準；
4、土壤硝態氮和速效磷富集，設施土壤硝態氮和速效磷大量積累，對生態環境構成了嚴重威脅，覆蓋面積超過設施蔬菜的50%；
5、土壤重金屬積累，設施菜田土壤中重金屬Cu、Zn和Cd呈逐漸積累的趨勢，采樣區設施菜田土壤Cd總體上處于污染警戒級狀況。
技術對策
化肥減量增效，協調養分比例，實現精準平衡施肥 。
重點協調好三個平衡：一是養分投入與產出的平衡；二是各種養分比例的平衡（針對土壤養分不平衡加劇、蔬菜生理病害增多等問題，需重視Ca、B、Zn、Fe 等施用）；三是施肥時期養分平衡（基追肥比例與數量平衡），實現設施蔬菜養分供應與吸收的同步調控。
生物肥/有機肥/有機物料部分替代化肥，培肥土壤，減施化肥 。
土壤基礎地力是實現作物產量潛力的關鍵因子。適于區域養分資源特點的生物肥/有機肥/有機物料與化肥優化配施（或菌劑/高碳有機肥與化肥優化配施），能穩定提升土壤功能，加速養分循環利用，減施化肥，協調土壤養分與能量（碳）之間的平衡，提高土壤有機質，以保持設施菜田土壤高效生產和持續利用。
施用專用新型化肥，優化養分配比和功能，減施傳統化肥。
根據設施菜田土壤肥力狀況、蔬菜品種、種植茬口等，推廣應用適合蔬菜生長特點和養分需求的專用新型化肥。設施蔬菜專用肥/水溶性肥料養分配比更趨合理，對調節土壤磷素，促進土壤養分均衡供應，提高肥料利用率，增產改質具有重大作用。設施蔬菜緩控釋肥可延緩肥效期，調控養分供應強度和數量，減少追肥次數。增效復混肥可提高肥效，改善土壤結構，保持土壤健康，增產改質。
推廣水肥一體化技術，節水節肥，克服土壤鹽化。
水肥一體化技術是未來農業中具有廣闊前景的新技術，是設施蔬菜生產中最具潛力發展的技術。
推廣適于區域和作物特點以及生產實際需求的以平衡水肥調控為核心的水肥一體化技術，能按設施蔬菜生長各階段對養分的需求和土壤養分的供給狀況，將融為一體的水肥適時、定量、均勻、準確地輸送到蔬菜根部土壤，具有節工、節水、節肥、節藥、高產、高效、優質、環保等優點。
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